Изначально кофе Желтый Бурбон рос на французском остров Реюньон, в тот момент он назывался Бурбон в честь семьи короля. Йеменские монахи в 18 веке завезли французские сорта кофе в Бразилию, где до этого выращивали арабику сорта Типика. Вскоре кто-то из фермеров обнаружил новое растение: оно имело круглые желтые плоды, а его листья не имели красноватого цвета, присущего Типике. Новый сорт оказался на 15-20% урожайнее, и был назван Желтым Бурбоном.
Несмотря на это, разведение желтого сорта кофе Бурбон долго казалось нерациональным: растение было капризным, легко подвергалось болезням, и давало на 10% меньше ягод, чем сорт Сантос. Сами же зерна кофе имели малый калибр (15-16), что не позволяло причислить их к элитным сортам на протяжении долгого времени.
Однако особое богатство вкуса, которое зерна этого кофе получают за счет очень сладкой мякоти, сделали Желтый Бурбон одним из самых ценных сортов арабики. Его активное промышленное выращивание в Бразилии началось с 1945 г. - и постепенно удалось достичь культивации растений, дающих крупные кофейные зерна (17-18 калибр).